清水寺は１４００年の歴史の中で数多くの文化財を所有し、今日に伝えてきました。
国指定の重要文化財４件、島根県指定文化財８件
| 文化財区分 | 文化財名 |
|---|---|
| 国重要文化財 | 根本堂 ＜明徳４年（１３９９年）建立＞ |
| 同 | 木造十一面観音立像 ＜平安初期＞ |
| 同 | 弥陀三尊座像 ＜平安後期＞ |
| 同 | 丈六阿弥陀如来座像 ＜鎌倉初期＞ |
| 島根県指定文化財 | 三重塔 ＜安政６年、総欅造り＞ |
| 同 | 本尊十一面観音立像 ＜平安初期＞ |
| 同 | 線刻大日如来板石 ＜鎌倉初期＞ |
| 同 | 梵鐘 ＜室町時代＞ |
| 同 | 十一面観音懸け仏 ＜室町時代＞ |
| 同 | 熊野権現懸け仏 ＜室町時代＞ |
| 同 | 三重塔原図 ＜江戸後期＞ |
| 同 | 四天王像 ＜平安初期＞ |